Identyfikacja białek ze zmienionymi modyfikacjami post-translacyjnymi u pacjentów z epilepsją skroniową w różnych regionach mózgu
Identification of proteins with altered PTM levels in patients with temporal lobe epilepsy in different regions of the human brain
W skrócie
Naukowcy analizowali białka z mózgów pacjentów z epilepsją skroniową i znaleźli 35 białek, których chemiczne modyfikacje były zmienione w porównaniu ze zdrowymi osobami. Szczególnie interesowały ich zmiany w fosforylacji, czyli dodawaniu fosforu do białek, co zmienia ich funkcję. Wyniki sugerują, że te zmiany chemiczne białek mogą odgrywać ważną rolę w powstawaniu epilepsji skroniowej.
Oryginalny abstract (angielski)
In this study we have reanalyzed the original proteomic data from studies of hippocampal [DOI: 10.1172/jci.insight.188612] and temporal cortex [DOI: 10.1016/j.expneurol.2025.115361] tissues of patients with temporal lobe epilepsy. The goal was to identify proteins whose levels of post-translational modifications (PTMs) could be altered in this disease. Three datasets (PXD064519, ZMP8KU, and PXD010154) deposited at PRIDE and Texas Data Repository were used. Phosphorylation and N-terminal acetylation were considered as target PTMs. During re-identification of peptides we considered only peptides, for which both variants (with and without PTMs) were identified. A data comparison algorithm independent of experimental data alignment between individual samples was used. As a result, 35 proteins were selected that showed significant changes in phosphorylation levels. For 12 of these proteins, significant changes were recorded in both data sets. Twenty-nine proteins from this list have been linked to epilepsy pathogenesis in the literature.